سیستانی کوشید تا از تنش های فرقه ای کاسته، ناآرامی های اجتماعی را کنترل کند و مسئولیت اخلاقی شهروندان عراقی را بالا برد. به گونه ای که در طول دوران زعامت وی نمی توان اظهار نظر یا عملکرد فرقه گرایانه ای از وی مشاهده کرد
